根據生物質鍋爐的種類、原始污染物濃度、煙氣排放指標要求，可選擇技術可行、運行成本低的技術方案 。生物質鍋爐用戶也可選擇合適的脫硫脫根據生物質鍋爐煙氣的特點，結合生物質燃料脫硝方案。

（1）與燃煤煙氣相比，生物質鍋爐的爐膛溫度差別大、煙氣含水量高、煙塵堿金屬含量高、二氧化硫、氮氧化物濃度低、波動大，其對脫硫脫硝方案的選擇都有較大影響。

（2）對煙氣污染物排放指標要求不高的地區，爐內噴鈣、爐外噴鈣、低氮燃燒、SNCR技術是十分適用的脫硫脫硝技術;對煙氣污染物排放指標要求高的地區，脫硝采用低氮燃燒、SNCR、O3氧化的組合、脫硫采用濕法脫硫的技術方案比較合適，其中脫硫脫硝一體化的技術方案更有優勢。